近日,我校李鈞敏教授國際合作團隊在知名期刊《Horticulture Research》(中科院一區TOP,五年影響因子8.2,入選中國科技期刊卓越行動計劃領軍類期刊)上在線發表題為“Genomic data provides insights into the evolutionary history and adaptive differentiation of two tetraploid strawberries”的研究論文,團隊林漢揚副教授為論文第一作者,李鈞敏教授為通訊作者,伟徳国际官网登录入口為第一單位。
多倍體植物與其二倍體祖先間的生态位進化式樣及其遺傳背景是生态學領域長期關注的議題。該論文以薔薇科草莓屬(Fragaria)植物為研究對象,組裝了傘房草莓等五種野生草莓的染色體級别全基因組,聚焦兩個我國特有的四倍體物種傘房草莓(F. corymbosa)和西南草莓(F. moupinensis)開展了相關研究。全基因組數據顯示,二倍體中國草莓是四倍體傘房草莓最有可能的祖先,而四倍體西南草莓的祖先可能是未被采樣的中國草莓群體或已滅絕的中國草莓近緣物種;同時,二倍體草莓物種間存在廣泛的基因漸滲。結合轉錄組數據,該研究發現四倍體物種較之其二倍體祖先在與紫外線輻射、DNA修複等相關基因中呈現出基因家族擴張和轉錄水平上升,而在與各類脅迫響應相關的基因中顯示出基因家族收縮和轉錄水平下降,為該熱點議題提供了重要的分子遺傳學啟示。
該項研究得到了國家自然科學基金委員會(NSFC)與美國國家科學基金會(NSF)中美生物多樣性專項的資助。美國匹茲堡大學Tia-Lynn Ashman教授、美國俄勒岡州立大學Aaron Liston教授、杭州師範大學董鳴教授等參與指導了該項研究。
論文鍊接:https://doi.org/10.1093/hr/uhae194