作    者：蔣明，管銘，潘小翠
影響因子：0
刊物名稱：核農學報
出版年卷：2013, 27(8): 1118-1124

文章摘要：CCCH鋅指蛋白(Zinc finger proteins)廣泛分布于動物、植物和微生物之中，在RNA代謝過程中起着重要作用，通過鑒定核盤菌和灰葡萄孢菌Zf基因，為基因克隆、表達分析和功能研究奠定基礎。本研究以核盤菌和灰葡萄孢菌全基因組序列為材料，運用生物信息學的手段開展Zf基因的全基因組鑒定和分析。經分析，核盤菌和灰葡萄孢菌各有11個Zf基因，它們的開放性閱讀框全長分别為663-3741bp和633-3486bp；共檢測到55個CCCH鋅指基序，以C-X7-C-X5-C-X3-H(22個)和C-X8-C-X5-C-X3-H(21個)最為常見，其中C-X8-C-X6-C-X3-H和C-X7-C-X6-C-X3-H為2種新發現的基序類型；進化分析結果表明，22個Zf基因聚為4組，除SS1G_13631、SS1G_09360、BC1T_00310和 BC1T_05217外，核盤菌和灰葡萄孢菌的Zf基因分别位于不同的小分支，該結果與Zf基因的基因結構、基序數量和分布情況一緻。

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